1. 哈尔滨市（副省级）
松花江（干流），松花江干流横贯城区；城内内河：何家沟、阿什河 。
2. 齐齐哈尔市
嫩江（松花江最大支流），嫩江纵贯主城区；劳动湖为嫩江连通的城市湖泊 。
3. 牡丹江市
牡丹江（松花江支流），城市因江得名，穿城而过 。
4. 佳木斯市
松花江（干流），横贯市区北部；城市内河：王三五河、音达木河等 。
5. 大庆市
主城区无大型天然大江穿城，主城区以湖泊群为主，安肇新河为人工河。
6. 鸡西市
穆棱河（乌苏里江支流），穿过鸡西主城区。
7. 鹤岗市
鹤立河（梧桐河支流，梧桐河是松花江支流），流经主城区；梧桐河在市域南部，不穿市区核心。
8. 双鸭山市
安邦河（松花江支流），穿双鸭山主城区。
9. 伊春市
伊春河（汤旺河支流，汤旺河是松花江支流），穿伊春市区；汤旺河在城区外围，不穿过中心城区。
10. 七台河市
倭肯河（松花江支流），贯穿七台河主城区，桃山湖为倭肯河上水库 。
11. 绥化市
呼兰河（松花江支流），穿过绥化主城区。
12. 黑河市
黑龙江（界江），黑河主城区紧邻黑龙江；公别拉河穿城区南部。
13. 大兴安岭地区（行署：加格达奇）
甘河（嫩江支流），横贯加格达奇主城区 。
速记小结
- 松花江干流穿城：哈尔滨、佳木斯
- 嫩江水系：齐齐哈尔（嫩江）、加格达奇（甘河）
- 松花江支流穿城：牡丹江（牡丹江）、伊春（伊春河）、七台河（倭肯河）、绥化（呼兰河）、双鸭山（安邦河）、鹤岗（鹤立河）
- 乌苏里江水系：鸡西（穆棱河）
- 中俄界江：黑河（黑龙江）
- 大庆：无天然大江穿主城区，多湖泊与人工河
