三水境内河涌纵横，岗丘与平原交错分布。先民大多选择高地或堤岸定居，聚族而居。宋元时期陆续有宗族迁入，明清两代村落数量快速增长，祠堂、书舍、圩市相继兴建。除沿江、水网地带之外，山乡之间还散落着一批古村，有的扼守北江渡口，有的藏在三水北部的客家山区，有的依靠古祠、老手艺留存历史印记。下文依照建村年代先后，寻访这十四座古村。
一、长岐村（芦苞镇，属独树岗村委会）
长岐村于元末明初，约1365年建村。村落背靠文笔山，三面被水系环绕，保存近百栋明清古建筑，卢、黄、何、钟四姓各建有本族祠堂。屋舍顺着坡地排布，巷道交错，旧时村民出行多依靠舟船。村内祠堂、古井、老树留存较好，是三水北部格局保存较为完整的古村落。数百年来四姓在此比邻而居，山水环境与宗族传统共同维系着古村的生活秩序；这里也与中篇所记的独树岗自然村相邻，同属一片水网。
二、村头村（芦苞镇，西河村委会）
村头村于明洪武元年，即1368年开村，距今六百五十余年。村落地处北江对岸，早年仅能依靠渡轮往来，当地俗称"芦苞的西伯利亚"。岑氏是村内大族，岑氏宗祠为三层会堂式建筑，占地约八百平方米，牌匾记载光绪戊子岁重修；上世纪三十年代末祠堂遭战火损毁，1980年由旅港乡亲捐资重建。祠堂旁保留健亭书舍、子通书舍。岑氏一族素来崇文重教，先后修建至少十二座书舍，培育出不少文人。
三、丰湖村（芦苞镇，西河村委会）
明正德九年，即1515年，李氏先祖李罗生迁居此地开基，创立丰湖村。村内李氏宗祠始建于清末，1992年原址重建，为四合院布局，占地约三百五十平方米，保留石柱、木雕与彩绘。上世纪五十年代，祠堂曾用作村中小学，不少本地老人仍记得在祠堂读书的往事。村落背靠丘陵，前临田园，李氏族人在此世代繁衍。
四、梅花村（大塘镇，六一村委会）
梅花村于明代建村，属六一村委会。村内胡氏宗祠始建于明崇祯九年，即1636年，2000年重修；村中原有十一座镬耳屋，至今仍有数座保留。老屋留存两扇雕花窗，窗上纹样究竟是梅花还是木棉花，当地村民长久以来各有说法。村落背山面水，古时武风兴盛，曾出过武举人，现存镬耳屋的建筑规制，也呼应着这段过往。
五、莘田村（大塘镇）
莘田村在明代已成聚落，清代文风鼎盛，村内留存多项科举实物遗存。清同治七年，即1868年，村人李仪清考中进士，祠堂前竖立旗杆石；后续还有八位族人取得功名，其中李焕尧殿试二甲，选为翰林院庶吉士。村内保存约三十座镬耳屋，集中分布在二十五巷至三十二巷。李氏宗祠为清代建筑，列入市级优秀历史建筑名录。旗杆石与成片镬耳屋，记录着这座古村耕读传家的传统。
六、上塘村（芦苞镇）
清初，上塘逐步形成村落，曹岗竹编技艺随之兴起。竹编是当地传统生计，匠人以竹篾编织篮筐，结实耐用，是旧时农家常用器具。如今掌握全套手艺的老手艺人不足十人，年轻人少有传承，老匠人还能在竹篮表面编出文字。村落坐落于芦苞涌上游，塘边竹林依旧，这项传统手艺却日渐凋零。
七、乐屋村（南山镇，六和村委会）
清康熙至乾隆年间，客家先民自嘉应州、福建等地迁入六和山区，乐屋村随之形成。村内保存三水少见的客家围龙屋，祠堂与围屋合为一体，呈半圆形，前设池塘、后有化胎，是典型的客家建筑形制。上世纪八十年代之后，村民陆续迁出，老屋日渐残破。这座山间围龙屋，是客家先民落脚三水北端留下的实物印记。
八、六和村（南山镇）
清康熙至乾隆年间，客家先民陆续迁入，形成六和村。这里是三水少见的客家方言岛，九成以上村民使用客家话，地处佛山最北端，毗邻四会、清远。下辖禾生、高屋、楼房、深坑等自然村，禾生与高屋曾经共用德瑜李公祠。旧时村内有两口池塘，民间流传"一村两塘"的说法，村民曾铲平中间的塘基，将两塘合为一处。此地山高林密，方言与民俗独具特色，在三水古村中风格鲜明。
以下村落没有确切可考的建村年代，但留存有较为扎实的地方史料与实物遗存，一并收录。
九、㘵心村（西南街道）
㘵心村暂无确切建村记载。村名里的"㘵"是珠三角地名常用字，写法特别，常用于村落名称。村中的布心大祠堂规模不小，旧时屋脊上的镬耳在特殊年代被敲平，如今仍能从屋顶的痕迹看出当年的改动。一个祠堂的屋顶，记下了一段并不久远的年月，也让这座村子有了不同于别处的表情。
十、刘寨村（芦苞镇）
刘寨村暂无确切建村年代。村内的胥江祖庙始建于南宋嘉定年间，即1208至1224年，是三水现存最古老的庙宇之一，供奉北帝、观音、文昌，长久以来香火延续。北江航运繁盛之时，往来船只常在庙前停靠。庙的建造年代与村子的创村年代不能等同，但村因庙而聚，庙前香火与江上帆影相伴，是这一带早期人居的实证。
十一、永平村（大塘镇）
永平村暂无确切建村记载。村中留存有清代碉楼，墙体厚实，以水磨青砖砌筑，各层设花岗岩射击孔，是旧时乡间防御性建筑，与大塘境内刘屋、叶屋等处的碉楼形制相近。村落地处北江沿岸，旧时既赖农耕，也需防范水患与匪患。碉楼立在水网与田野之间，是解读这一带村落生存史的直接物证。
十二、高丰村（云东海街道）
高丰村暂无确切建村记载。"高丰"源自旧时堡名，村内留存启明门、北帝古庙、国琰吴公祠、村心张氏宗祠、九世吴公祠等清代建筑，何、吴等多个姓氏混居。木棉涌穿村而过，旧时村民临水而居，农耕与水上营生并举。一处村子同时留下门楼、庙宇和数座姓氏祠堂，可见当年聚落的规模。
十三、潦边村（大塘镇）
潦边村暂无确切建村记载，村名取自潦边涌。村落北部毗邻清远，辖区范围广阔，旧时以农耕为主；因地处要道，旧时曾有古驿道经过，并设过邮站，是三水北部往来的节点之一。行政沿革较为清晰：1952年归属治和乡，1958年设立大队，1983年改为乡，1997年设立村委会，2004年与横枝沥村委会合并。更早的创村史料缺失，村名始终与这条水道相伴。
十四、永丰村（大塘镇）
永丰村暂无确切建村记载。村名取长久丰收之意，是农耕聚落常见的命名方式，寄托先民期盼收成安稳的心愿。村落下辖多个自然村，耕地鱼塘兼备，村民历来以种养为生。村名与土地开发的线索，是推断其聚落成因仅有的依据，确切的开村年份已难查考。